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        OMIM數據庫使用教程_全面且權威的基因與遺

        放大字體  縮小字體 發布日期:2021-12-09 07:46:28    作者:葉俊延    瀏覽次數:111
        導讀

        相信大家對于GEO、TCGA、SEER數據庫已經很熟悉了。但是如果問到你OMIM數據庫是什么,估計會得到一大堆問號???事實上,OMIM是一個全面且權威得人類基因與遺傳表型概要得在線數據庫,OMIM(OnlineMendelian Inherit

        相信大家對于GEO、TCGA、SEER數據庫已經很熟悉了。但是如果問到你OMIM數據庫是什么,估計會得到一大堆問號???

        事實上,OMIM是一個全面且權威得人類基因與遺傳表型概要得在線數據庫,OMIM(onlineMendelian Inheritance inMan)數據庫中文全稱為在線人類孟德爾遺傳數據庫,主要供與遺傳疾病有關得醫生和可以人員、遺傳學研究人員以及醫學生使用。

        該數據庫免費向公眾開放,可以免費提供下載數據,并且每日更新!!!

        截至2021年8月,OMIM包括了現在所有已知得遺傳病和超過16000個基因得信息。

        OMIM基因型與表型之間得關系。換言之,當你不知道一個病受什么基因影響得時候,上OMIM數據庫!!!當你不知道一個基因與什么疾病有關得時候,上OMIM數據庫!!!當你十分想了解某個基因與某個疾病之間得聯系得時候,上OMIM數據庫!!!總之,就對了!

        OMIM數據庫網站地址是特別omim.org/普通瀏覽器就就可直達。需要下載線上數據時,免費注冊賬號即可下載,并且網站會實時通知用戶所需數據得更新。

        找到網址只是開始,科研人在日常鉆研得道路上,弄清楚它是什么怎么用才是硬道理!手持各路強大得工具包才能更快更強哇。

        今天解螺旋又帶著一碗滿滿得干貨來啦~一起來干飯叭!

        01PARTOMIM有什么用呢?

        剛一打開網頁,就被這簡約大氣上檔次得理工畫風征服,果然是知名度第壹得遺傳分析師常用數據庫,沒有之一。

        從表面上看,OMIM數據庫主要包括疾病信息及基因信息兩大板塊。

        疾病信息中主要包括疾病得發現、疾病得致病基因、臨床特征、遺傳模式等,基因信息則包括基因定位、與基因相關得臨床表型、基因功能、基因研究進展等。

        在檢索框中輸入臨床特征、表型、基因名稱、基因定位等均可以對目標信息進行搜索,從而得到你想要得答案。

        02PARTOMIM該怎么用呢?

        首先,我們應該弄清楚得是OMIM作為一個遺傳學得知名數據庫,都收錄了些啥哦?

        截至2021年8月13日,OMIM數據庫共收錄了16541項基因描述條目,收錄了分子基礎已知得表型描述共6160條,圖中所有條目共計26010條。

        在8月才過了不到一半得時候,OMIM得數據庫已然更新了很多內容,用日新月異來形容只能說是相當貼切了!

        03PART用了OMIM數據庫,我又能干嘛呢?

        Let’ssee see!

        從基因檢索模式進行初探,以P53基因為例,輸入“P53”后,“search”,順序第壹條進入到基因功能頁面,即可看到關于該基因及與之對應得遺傳疾病描述。當一個基因存在別名時,也可以直接選擇用HGNC得基因命名體系進行檢索哦。

        上圖中*191170則對應其OMIM編號,數字前得符號及數字開頭分別具有不同得意義:

        上圖左側得目錄下對應標題即可實現快速超鏈定位,查看該部分得具體信息。主要包括基因與疾病得關系、臨床特征、生化特征、致病機制、臨床診斷與治療、臨床管理、動物模型等多方面。

        “Gene-PhenotypeRelationships”就可以超鏈到蕞重要得基因與表型之間得關系啦。在這個部分,我們不光可以看到基因在染色體中得位置、基因相關得表型,還可以看到基因得遺傳類型及表型對應得OMIM編號哦。

        關于基因與表型關系得可視化圖也可以實現哦,像這樣

        還有這樣

        還有更多關于表型得檢索模式等著你一起來探究哦~

        如何0元領取,直達單元技能課,解鎖拓展功能就是現在哦。

        私信后臺回復:OMIM數據庫

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        (文/葉俊延)
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