農家肥大多于人畜糞便、作物秸稈、雜草、枯枝落葉、生活垃圾等，這類農家肥需發酵腐熟后才能作為肥料施入農田。
常用的發酵腐熟方法是高溫堆肥，是利用好熱性微生物將農業廢棄物中能夠分解的有機物進行生物降解，使其成為一類肥沃的腐殖土物質的過程，通過這一過程，能夠使纖維素分解為腐殖質，成為能被植物吸收利用的養分。同時，發酵過程中的高溫可將其中多種有害生物殺死。
一、方法步驟
原料：作物秸稈、枯枝、樹葉及雜草（要鍘成5～15厘米）、生活垃圾等，人畜糞便占重量比的不少于10%，人畜糞便越多越好。
混料：將原料混均，加入一定量的水（含水量50%～60%），有條件的均勻混入0.1%～0.2%的專用堆肥發酵菌劑。加入發酵劑發酵腐熟快、徹底；不加，原料自身有一定量的發酵菌。
堆積：將混料堆積，底寬各2～3米，高1.5～2米，長不限。混料的充實程度以自然堆積時實度為好，堆好后在堆上覆蓋塑料薄膜以保溫、保濕。
翻堆：堆腐20天后進行第壹次翻堆，再繼續堆腐20天，進行第二次翻堆。當堆肥表層形成以真菌菌絲為全的白毛時，標志堆肥進入嫌氣發酵（不需要氧氣參與）階段，此時應將肥堆壓實，用塑料薄膜密封，作用是保溫、保濕和防止氮肥的損失，使其緩慢地進行后期的腐熟。一般堆肥所需時長，夏季約需1～2個月，冬季約需3～4個月即可腐熟使用。
場地選擇：高溫堆肥地址要求不嚴格，一般選在地勢平坦干燥，水源充足，交通運輸方便的路邊或地頭。
二、注意事項 料堆中不要摻土，因摻土會導致發酵較慢，影響腐熟過程中堆肥溫度升高，延長腐熟所需時間，質量較差。溫度、含水量與氧氣濃度能夠影響農家肥腐熟度，腐熟度可靠些溫度為70℃～80℃，可靠些含水量為48.6%～59.8%。
三、腐熟程度農家肥腐熟程度以完全腐熟為好，但在實際操作中常達不到完全腐熟，即半腐熟。
半腐熟：農家肥在堆積過程中經過微生物的作用，有機質分解礦化，植物組織推動了原來的堅韌性，變成柔軟的物質，可見原來形狀，但不刺手，很易折斷破碎，呈棕褐色，即半腐熟。
全腐熟：植物組織經分解作用，完全喪失了原來的形態特征，看不出原來形狀，變成松軟一團，即全腐熟。全腐熟標志有：原來的混料呈褐色或灰褐色，粒狀或粉狀，堆溫降低，物料疏松，無原料本來的臭味，稍有氨味，堆內產生白色菌絲。（何子順）
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